A partir del 29 de abril del año 2013 el Ministerio de Educación de la Provincia de Jujuy, realiza un convenio de cooperación con la Biblioteca del Convento, con el fin de promover y difundir la cultura y la ciencia conservando el Patrimonio Bibliotecológico y Archivístico de la Orden Franciscana en la provincia. En la actualidad mantiene el convenio haciéndolo extensivo a todo el Complejo Cultural san Francisco, con el mismo fin y prevaleciendo el aporte cultural e histórico que ofrece a través de los servicios de aprendizaje y recursos que permiten a todos los miembros de la comunidad escolar de todos los niveles y público en general, forjarse un pensamiento crítico y utilizar eficazmente la información en cualquier formato y medio de comunicación.

Hasta el 2018 se contaban con un inventario de 10123 libros y 1505 ejemplares de publicaciones periódicas. A esa fecha se empezó a realizar un catálogo digital por anaquel para el acceso directo al material. Con la colaboración y trabajo conjunto con el Mtr. Ing. Ariel Alejandro Vega, docente de la Universidad Nacional de Jujuy (UNJU). También se cuenta con un catálogo manual del área de Historia de Jujuy, realizado por la Técnicas Bibliotecólogas, Fabiana Soledad Chañi y Valeria Marisol Mealla, alumnas de la carrera Licenciatura en Bibliotecología de la Universidad Católica de Santiago del Estero (UCSE) con sede en Jujuy.